Sebetsa se Secha sa Tlhahlobo ea Lefuba le ho Fumana Khanyetso ea Lithethefatsi: Tatellano e Reriloeng ea Moloko o Mocha (tNGS) e Kopantsoeng le Thuto ea Mochini bakeng sa Tlhahlobo ea Hypersensitivity ea Lefuba
Tlaleho ea lingoliloeng: CCa: mohlala oa tlhahlobo o thehiloeng ho tNGS le ho ithuta ha mochini, o loketseng batho ba nang le lefuba le sa baketheng haholo le meningitis ea lefuba.
Sehlooho sa sengoloa: Tatellano ea moloko o latelang e shebaneng le lefuba le ho ithuta ka mochini: leano la tlhahlobo le nang le kutlo e matla haholo bakeng sa li-tubular tsa matšoafo tse sa phutholohang le meningitis ea tubular.
Nako le nako: 《Clinica Chimica Acta》
HAEBA: 6.5
Letsatsi la phatlalatso: Pherekhong 2024
Ha e kopantsoe le Univesithi ea Chinese Academy of Sciences le Sepetlele sa Beijing Chest sa Capital Medical University, Macro & Micro-Test e thehile mohlala oa tlhahlobo ea lefuba o thehiloeng molokong o mocha oa theknoloji e reretsoeng ho latellana (tNGS) le mokhoa oa ho ithuta oa mochini, o faneng ka kutloisiso e phahameng haholo ea lefuba le nang le libaktheria tse fokolang le meningitis ea lefuba, o fane ka mokhoa o mocha oa tlhahlobo ea hypersensitivity bakeng sa tlhahlobo ea bongaka ea mefuta e 'meli ea lefuba,' me o thusitse tlhahlobo e nepahetseng, ho lemoha ho hanyetsa lithethefatsi le kalafo ea lefuba. Ka nako e ts'oanang, ho fumanoa hore cfDNA ea plasma ea mokuli e ka sebelisoa e le mofuta o loketseng oa sampole bakeng sa ho nka sampole ea bongaka ho hlahlobeng TBM.
Phuputsong ena, disampole tse 227 tsa plasma le disampole tsa mokelikeli oa boko li sebelisitsoe ho theha lihlopha tse peli tsa kliniki, moo disampole tsa sehlopha sa tlhahlobo ea laboratori li sebelisitsoeng ho theha mohlala oa ho ithuta oa tlhahlobo ea lefuba ka mochini, 'me disampole tsa sehlopha sa tlhahlobo ea bongaka li sebelisitsoe ho netefatsa mohlala o thehiloeng oa tlhahlobo. Lisampole tsohle li ile tsa qala ka ho shejoa ke letamo la lipatlisiso tse reretsoeng ho hapa Mycobacterium tuberculosis. Ebe, ho latela data ea tatellano ea TB-tNGS, mohlala oa sefate sa liqeto o sebelisoa ho etsa netefatso ea makhetlo a 5 holim'a lisete tsa koetliso le netefatso ea mola oa tlhahlobo oa laboratori, 'me meeli ea tlhahlobo ea lisampole tsa plasma le lisampole tsa mokelikeli oa boko lia fumanoa. Moeli o fumanoeng o tlisoa liseteng tse peli tsa liteko tsa mola oa tlhahlobo ea bongaka bakeng sa ho fumanoa, 'me ts'ebetso ea tlhahlobo ea moithuti e hlahlojoa ka mokhoa oa ROC. Qetellong, mohlala oa tlhahlobo ea lefuba o fumanoe.
Setšoantšo sa 1 sa moralo oa lipatlisiso
Liphetho: Ho ea ka meeli e ikhethileng ea sampole ea DNA ea CSF (AUC = 0.974) le sampole ea cfDNA ea plasma (AUC = 0.908) e fumanoeng thutong ena, har'a lisampole tse 227, kutloisiso ea sampole ea CSF e ne e le 97.01%, ho hlaka e ne e le 95.65%, 'me kutloisiso le ho hlaka ha sampole ea plasma e ne e le 82.61% le 86.36%. Tlhahlobong ea lisampole tse 44 tse kopantsoeng tsa cfDNA ea plasma le DNA ea mokelikeli oa cerebrospinal ho tsoa ho bakuli ba TBM, leano la tlhahlobo la thuto ena le na le botsitso bo phahameng ba 90.91% (40/44) ho cfDNA ea plasma le DNA ea mokelikeli oa cerebrospinal, 'me kutloisiso ke 95.45% (42/44). Ho bana ba nang le lefuba la matšoafo, leano la tlhahlobo la thuto ena le na le kutloelo-bohloko haholoanyane ho lisampole tsa plasma ho feta liphetho tsa tlhahlobo ea Xpert ea lisampole tsa lero la gastric ho tsoa ho bakuli ba tšoanang (28.57% VS 15.38%).
Setšoantšo sa 2 Ts'ebetso ea tlhahlobo ea mohlala oa tlhahlobo ea lefuba bakeng sa lisampole tsa baahi
Setšoantšo sa 3 Liphetho tsa tlhahlobo ea lisampole tse kopantsoeng
Qeto: Mokhoa oa ho hlahloba lefuba ka mokhoa o feteletseng o thehiloe thutong ena, o ka fanang ka sesebelisoa sa ho hlahloba se nang le kutloelo-bohloko e phahameng ka ho fetisisa bakeng sa bakuli ba kliniki ba nang le lefuba la oligobacillary (setso se seng). Ho lemoha lefuba ka mokhoa o feteletseng ho latela plasma cfDNA e ka ba mofuta o loketseng oa sampole bakeng sa ho hlahloba lefuba le mafolofolo le meningitis ea lefuba (lisampole tsa plasma li bonolo ho li bokella ho feta mokelikeli oa cerebrospinal bakeng sa bakuli ba belaelloang hore ba na le lefuba la boko).
Sehokelo sa mantlha: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? via%3Dihub
Selelekela se sekhutšoanyane sa lihlahisoa tsa tlhahlobo ea lefuba la Macro le Micro-Test
Ka lebaka la boemo bo rarahaneng ba sampole ba bakuli ba lefuba le litlhoko tse fapaneng, Macro & Micro-Test e fana ka sete e felletseng ea litharollo tsa NGS bakeng sa ho ntša metsi lisampoleng tsa sekhohlela, kaho le tatellano ea laeborari ea Qualcomm, le tlhahlobo ea data. Lihlahisoa li akaretsa tlhahlobo e potlakileng ea bakuli ba lefuba, ho lemoha lefuba le hanyetsanang le lithethefatsi, ho thaepa lefuba la mycobacterium le NTM, tlhahlobo ea hypersensitivity ea lefuba le se nang baktheria le batho ba nang le lefuba, jj.
Likiti tsa ho lemoha lefuba le mycobacteria ka bongata:
| Nomoro ea Ntho | lebitso la sehlahisoa | diteng tsa teko ya sehlahiswa | mofuta oa sampole | mohlala o sebetsang |
| HWTS-3012 | Moemeli oa tokollo ea mohlala | E sebelisitsoe kalafong ea ho nosetsa lisampole tsa sekhohlela, e fumane nomoro ea rekoto ea boemo ba pele, Sutong Machinery Equipment 20230047. | sekhohlela | |
| HWTS-NGS-P00021 | Sete ea ho lemoha bongata ba Qualcomm bakeng sa lefuba le nang le hypersensitivity (mokhoa oa ho hapa probe) | Ho lemoha hypersensitivity e sa hlaseleng (biopsy ea metsi) bakeng sa lefuba la matšoafo le se nang baktheria le li-nodule tsa boko; Lisampole tsa batho ba belaelloang hore ba tšoaelitsoe ke lefuba kapa mycobacteria e seng ea lefuba li ile tsa hlahlojoa ka metagenomics e tebileng ea tatellano, 'me tlhahisoleseling ea ho lemoha hore na mycobacteria ea lefuba kapa e seng ea lefuba e tšoaelitsoe le tlhahisoleseling ea mantlha ea ho hanyetsa meriana ea mycobacterium tuberculosis e fanoe. | Mali a ka thoko, mokelikeli oa ho hlatswa ka alveolar, hydrothorax le ascites, sampole ea ho phunya ka ho tsepamisa mohopolo, mokelikeli oa boko. | Moloko oa bobeli |
| HWTS-NGS-T001 | Sete ea ho lemoha ho thaepa ha Mycobacterium le ho hanyetsa lithethefatsi (mokhoa oa ho latellana ha ho hoholo ha amplification) | Teko ea ho thaepa ea Mycobacterium, ho kenyeletsoa MTBC le 187 NTM；Ho lemoha lefuba la Mycobacterium ho hanyetsa meriana ho akaretsa meriana e 13 le libaka tse 16 tsa mantlha tsa phetoho ea liphatsa tsa lefutso tse hanyetsang meriana. | Sekhohlela, mokelikeli oa ho hlatswa ka alveolar, hydrothorax le ascites, sampole ea ho phunya ka ho tsepamisa mohopolo, mokelikeli oa boko. | Sethala sa bobeli sa moloko oa bobeli/oa boraro |
Lintlha-khōlō: HWTS-NGS-T001 Mycobacterium typing and drug resistance detection kit (mokhoa oa multiplex amplification)
Selelekela sa sehlahisoa
Sehlahisoa sena se thehiloe holim'a meriana e meholo ea pele le ea bobeli e hlalositsoeng litataisong tsa kalafo ea TB ea WHO, li-macrolide le li-aminoglycoside tse sebelisoang hangata litataisong tsa kalafo ea NTM, 'me libaka tsa ho hanyetsa lithethefatsi li akaretsa sehlopha sohle se le seng sa libaka tse amanang le ho hanyetsa lithethefatsi lethathamong la liphetoho tsa Mycobacterium tuberculosis complex tsa WHO, hammoho le liphatsa tse ling tse tlalehiloeng tsa lefutso la ho hanyetsa lithethefatsi le libaka tsa phetoho ho latela lipatlisiso le lipalo-palo tsa lingoliloeng tse nang le lintlha tse phahameng lapeng le kantle ho naha.
Ho hlwaya ka ho thaepa ho itshetlehile hodima mefuta ya NTM e akaretswang ditataisong tsa NTM tse phatlaladitsweng ke Chinese Journal of Tuberculosis and Respiratory Diseases le tumellano ya ditsebi. Di-primer tse entsweng ka ho thaepa di ka hodisa, tsa hlophisa le ho hlalosa mefuta e fetang 190 ya NTM.
Ka theknoloji ea ho eketsa matla a PCR a multiplex e reretsoeng, liphatsa tsa lefutso tsa genotyping le liphatsa tsa lefutso tse hanyetsanang le meriana tsa Mycobacterium li ile tsa matlafatsoa ke multiplex PCR, 'me motsoako oa amplicon oa liphatsa tsa lefutso tse reretsoeng ho fumanoa o ile oa fumanoa. Lihlahisoa tse matlafalitsoeng li ka hahoa lilaebraring tsa tatellano ea meloko ea bobeli kapa ea boraro ea meloko ea boraro, 'me li-platform tsohle tsa tatellano ea meloko ea bobeli le ea boraro li ka etsoa tlhahlobo e tebileng ho fumana tlhaiso-leseling ea tatellano ea liphatsa tsa lefutso tse reretsoeng. Ka ho bapisa le liphetoho tse tsejoang tse fumanehang polokelongtshedimosetsong ea litšupiso e hahiloeng kahare (ho kenyeletsoa le lethathamo la liphetoho tse rarahaneng tsa WHO Mycobacterium tuberculosis le kamano ea eona le ho hanyetsa lithethefatsi), liphetoho tse amanang le ho hanyetsa lithethefatsi kapa ho ba kotsing ea meriana e loantšang lefuba li ile tsa fumanoa. Ha li kopantsoe le tharollo ea kalafo ea sampole ea sputum e ipulelang ea Macro & Micro-Test, bothata ba katleho e tlase ea nucleic acid ea ho eketsa lisampole tsa sputum tsa kliniki (e phahameng ka makhetlo a leshome ho feta ea mekhoa ea setso) bo ile ba rarolloa, e le hore ho lemoha tatellano ea ho hanyetsa lithethefatsi ho ka sebelisoa ka kotloloho lisampoleng tsa sputum tsa kliniki.
Mefuta ea ho lemoha sehlahisoa
34liphatsa tsa lefutso tse amanang le ho hanyetsa lithethefatsi tsa18meriana e thibelang lefuba le6Meriana ea NTM e fumanoe, e koahelang297libaka tse hanyetsanang le meriana; Mefuta e leshome ea lefuba la Mycobacterium le tse fetang190mefuta ea NTM e fumanoe.
Tafole ea 1: Tlhahisoleseling ea Lithethefatsi tse 18+6 +190+NTM
Molemo oa sehlahisoa
Ho ikamahanya le maemo ho matla a kliniki: disampole tsa sekhohlela li ka bonoa ka ho toba ka sesebelisoa sa ho itšehla thajana ntle le ho lengoa.
Tshebetso ya teko e bonolo: potoloho ya pele ya tshebetso ya ho hodisa e bonolo, mme kaho ya laeborari e phethelwa ka dihora tse 3, e leng se ntlafatsang bokgoni ba mosebetsi.
Ho thaepa ka botlalo le ho hanyetsa lithethefatsi: ho akaretsa libaka tsa ho thaepa le ho hanyetsa lithethefatsi tsa MTB le NTM, e leng lintlha tsa bohlokoa tsa tlhokomelo ea bongaka, ho lemoha ho thaepa ka nepo le ho hanyetsa lithethefatsi, ho tšehetsa software e ikemetseng ea tlhahlobo, le ho hlahisa litlaleho tsa tlhahlobo ka ho tobetsa hanngoe feela.
Ho lumellana: ho lumellana ha sehlahisoa, ho ikamahanya le li-platform tse tloaelehileng tsa ILM le MGI/ONT.
Tlhaloso ea sehlahisoa
| Khoutu ea sehlahisoa | lebitso la sehlahisoa | Sethala sa ho lemoha | litlhaloso |
| HWTS-NGS-T001 | Kiti ea ho lemoha ho thaepa ha Mycobacterium le ho hanyetsa lithethefatsi (mokhoa oa ho eketsa bongata) | ONT, Illumina, MGI, Salus pro | 16/96rxn |
Nako ea poso: Pherekhong-23-2024